Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc2P20801 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc2P20801 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnc2P20801 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnc2P20801 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms