Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrneP20782 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrneP20782 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrneP20782 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms