Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SagP20443 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SagP20443 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SagP20443 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SagP20443 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SagP20443 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SagP20443 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SagP20443 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SagP20443 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms