Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P10404 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P10404 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P10404 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P10404 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P10404 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P10404 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P10404 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P10404 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P10404 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P10404 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P10404 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms