Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms