Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm2P0DP27 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calm2P0DP27 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calm2P0DP27 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calm2P0DP27 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Calm2P0DP27 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calm2P0DP27 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms