Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms