Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me1P06801 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me1P06801 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Me1P06801 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me1P06801 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me1P06801 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me1P06801 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me1P06801 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me1P06801 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me1P06801 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me1P06801 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Me1P06801 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Me1P06801 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Me1P06801 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Me1P06801 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Me1P06801 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms