Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Got1P05201 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Got1P05201 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Got1P05201 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Got1P05201 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Got1P05201 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Got1P05201 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Got1P05201 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Got1P05201 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Got1P05201 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Got1P05201 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Got1P05201 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Got1P05201 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Got1P05201 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Got1P05201 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Got1P05201 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Got1P05201 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Got1P05201 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Got1P05201 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Got1P05201 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Got1P05201 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Got1P05201 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Got1P05201 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Got1P05201 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Got1P05201 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms