Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3dP04235 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd3dP04235 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms