Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GzmbP04187 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GzmbP04187 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GzmbP04187 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms