Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apaf1O88879 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apaf1O88879 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms