Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms