Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FxnO35943 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FxnO35943 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FxnO35943 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FxnO35943 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FxnO35943 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FxnO35943 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FxnO35943 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FxnO35943 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FxnO35943 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FxnO35943 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FxnO35943 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FxnO35943 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FxnO35943 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FxnO35943 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FxnO35943 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FxnO35943 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FxnO35943 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FxnO35943 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FxnO35943 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FxnO35943 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FxnO35943 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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