Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms