Protein–RNA interactions for Protein: O35885

Ascl2, Achaete-scute homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl2O35885 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl2O35885 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl2O35885 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ascl2O35885 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms