Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccrl2O35457 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccrl2O35457 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms