Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd9O35177 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms