Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitx3O35160 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx3O35160 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms