Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarb2O35114 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Scarb2O35114 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Scarb2O35114 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Scarb2O35114 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarb2O35114 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarb2O35114 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms