Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcof1O08784 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcof1O08784 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcof1O08784 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms