Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfil3O08750 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms