Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20878L7N244 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20878L7N244 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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