Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5294J3QP53 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm5294J3QP53 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm5294J3QP53 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm5294J3QP53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Gm5294J3QP53 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5294J3QP53 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm5294J3QP53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm5294J3QP53 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5294J3QP53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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