Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc180J3QNE4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc180J3QNE4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc180J3QNE4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc180J3QNE4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms