Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pcf11G3X9Z4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcf11G3X9Z4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcf11G3X9Z4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms