Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgxb3G3X9M3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmgxb3G3X9M3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms