Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5160F8VPN3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5160F8VPN3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms