Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933403O08RikF6UK53 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms