Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28374F6SG70 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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