Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm1E9Q9Q2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3hdm1E9Q9Q2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms