Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc146E9Q9F7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms