Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd35E9Q9D8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd35E9Q9D8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms