Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Simc1E9Q6E9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Simc1E9Q6E9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms