Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtproE9Q612 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtproE9Q612 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms