Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdhb9E9Q5G2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms