Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip11E9Q512 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip11E9Q512 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trip11E9Q512 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip11E9Q512 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms