Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc71lE9Q4T4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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