Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd1E9Q3H4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms