Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tarbp1E9Q368 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Tarbp1E9Q368 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tarbp1E9Q368 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms