Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8237E9Q257 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8237E9Q257 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms