Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3095E9Q058 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3095E9Q058 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms