Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcdh10E9PXQ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcdh10E9PXQ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pcdh10E9PXQ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms