Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc144bE9PVZ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc144bE9PVZ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms