Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syde2E9PUP1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms