Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clca3bE9PUL3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms