Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl3E0CZ16 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms