Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930558K02RikE0CXC6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms