Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam46aD3Z5S8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms