Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5430403G16RikD3Z5L4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms